Tuvo su origen en la Sección de Antropología del Instituto de Investigaciones Históricas, bajo la Dirección del Dr. Juan Comas, en 1973 se crea esta institución en la que conviven e interactúan especialistas de diferentes ramas de la antropología, lo que favorece la realización de uno de los logros más importantes de la escuela mexicana de nuestra disciplina: hacer investigaciones interdisciplinarias con enfoque antropológico integral. Uno de sus objetivos principales es llevar a cabo investigaciones de alta calidad académica que contribuyan a comprender el presente y el pasado de las civilizaciones humanas, a través de cuatro especialidades: la antropología física, la arqueología, la etnología y la lingüística antropológica, que han venido desarrollando diferentes líneas de investigación y contribuido al conocimiento antropológico de una manera destacada y reconocida internacionalmente. Así mismo, ser un promotor del resguardo del patrimonio cultural y una entidad que se preocupa por los problemas nacionales y por participar en sus soluciones.
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